Andrej Jemec se narodil v roce 1934 v Lublani. Absolvoval studium malířství na Akademii výtvarných umění a designu v Lublani (1953–1958) u profesorů Marije Preglije a Gabrijela Stupici a grafiky u profesorů Rika Debenjaka a Božidara Jakace. Po absolutoriu pokračoval díky stipendiu Prešernovy nadace ve studiu v Paříži (1963–1964) v ateliéru Johnnyho Friedlaendera a odkud nakrátko odjel do Londýna. Nejprve učil na základní škole v Šentvidu u Lublaně (1958–1961), poté byl v letech 1962–1973 umělcem na volné noze. V roce 1973 dokončil doktorandské studium a od roku 1984 vyučoval do roku 1999 kresbu a malbu na Akademii výtvarných umění a designu v Lublani pro studenty bakalářského a magisterského studia. V letech 1977–1981 byl dvakrát zvolen děkanem Akademie. V roce 1995 byl zvolen do Slovinské akademie věd a umění v Lublani jako přidružený člen a v roce 2001 jako řádný člen.
Stejně jako mnoho malířů jeho generace i Jemec postupně nalezl svobodu díky osvobozujícímu potenciálu barvy. Výrazové možnosti a narativy prostřednictvím linií se postupně zjemňovaly a propůjčovaly výhradní sílu chromatickému zobrazení, které zaujalo doslova ústřední místo. Barevné části totiž začal pomalu umisťovat do středu svých obrazů a vsadil na strukturální a sémantickou sílu barvy a světla.
Jemec se zúčastnil mnoha výstav, mimo jiné Benátského bienále (dvakrát – v letech 1970 a 1972), Bienále v Sao Paulu (dvakrát – v letech 1971 a 1977) a všech ročníků Bienále grafiky v Lublani v letech 1963–1999.
Za svou tvorbu získal řadu ocenění, mimo jiné: cenu na Bienále mladých jugoslávských umělců v chorvatské Rijece (1960), Grand Prix International na 4. mezinárodním bienále grafiky v Tokiu (1964), čestnou medaili na 3. mezinárodní výstavě grafiky v německém Frechenu (1974), Jakopičovu cena, Lublaň (1975), 1. cenu na 11. mezinárodním bienále grafiky, Lublaň (1975), Stříbrnou cenu na Mezinárodním trienále grafiky, Ósaka, Japonsko (1991), Prešerenovu cenu za celoživotní dílo, Lublaň (1994) a Zlatou plaketu Lublaňské univerzity (1998). V roce 2005 mu byl udělen Rakouský čestný kříž za vědu a umění a v roce 2010 Rakouský čestný kříž za vědu a umění I. třídy.
Andrej Jemec žije a pracuje v Lublani.