Andrej Jemec blev født i Ljubljana i 1934. Han studerede maleri ved Fine Arts and Design Academy i Ljubljana (1953-1958) hos professor Marij Preglj og professor Gabrijel Stupica og grafisk design hos professorerne Riko Debenjak og Božidar Jakac. Efter sin eksamen fortsatte han sin uddannelse i Paris (1963-64) i Johnny Friedlaender’s atelier takket være et tilskud fra Prešernov sklad (Prešeren Foundation), inden han flyttede til London. Efter at have undervist i en grundskole i Šentvid nær Ljubljana (1958-61) var han freelancekunstner fra 1962 til 1973. I 1973 afsluttede han sin ph.d.-forskning og begyndte i 1984 at undervise studerende, herunder kandidater under videregående studier, i tegning og maling ved Academy of Fine Arts and Design i Ljubljana, hvilket han fortsatte med at gøre indtil 1999. Han blev valgt til formand for akademiet to gange mellem 1977 og 1981. I 1995 blev han valgt til det slovenske akademi for videnskab og kunst i Ljubljana som associeret medlem og i 2001 som fuldgyldigt medlem.
Ligesom mange malere af sin generation fandt Jemec i stigende grad sin frihed ved at følge farvernes frigørende potentiale. Muligheder for udtryk og narrativer, der følger et spor, modnedes gradvist og blev lagt til den kraft, der alene rummes i den kromatiske fremstilling, som bogstavelig talt indtog en central plads. Han begyndte nemlig langsomt at indsætte farvede sektioner i midten af sine malerier, idet han udnyttede den strukturelle og semantiske kraft af farve og lys.
Jemec har deltaget i en lang række udstillinger, herunder Biennalen i Venedig (to gange — i 1970 og 1972), Sao Paulo Biennial (to gange — i 1971 og 1977) og alle udgaver af biennalen for grafisk kunst i Ljubljana mellem 1963 og 1999.
Han er blevet tildelt en lang række priser for sit arbejde, herunder: en pris ved Biennalen for Unge Jugoslaviske Kunstnere i Rijeka, Kroatien (1960); Grand Prix International i den fjerde International Biennial Exhibition of Prints, Tokyo (1964); Æresmedalje ved den tredje internationale udstilling af grafisk kunst, Frechen, Tyskland (1974); Jakopič-prisen, Ljubljana (1975), 1. pris ved den 11. International Biennial of Grafic Arts, Ljubljana (1975); Sølvmedalje på International Print Triennial, Osaka, Japan (1991); Prešeren Award for Lifetime Achievement for sit livsværk, Ljubljana (1994); Golden Plaque fra universitetet i Ljubljana (1998). I 2005 blev han tildelt Det Østrigske Æreskors for Videnskab og Kunst og i 2010 Det Østrigske Æreskors for Videnskab og Kunst af 1. klasse.
Andrej Jemec bor og arbejder i Ljubljana.