Andrej Jemec sündis 1934. aastal Ljubljanas. Ta õppis maali Ljubljana kunsti- ja disainiakadeemias (1953–1958) professorite Marij Preglj ja Gabrijel Stupica käe all ning graafilist disaini professorite Riko Debenjaki ja Božidar Jakaci juhtimisel. Pärast lõpetamist jätkas ta õpinguid Pariisis (1963–64) Johnny Friedlaenderi stuudios tänu toetusele sihtasutusest Prešernov Sklad, seejärel suundus Londonisse. Aastatel 1958–1961 õpetas ta Šentvidi algkoolis Ljubljana lähedal. 1962–1973 oli vabakutseline kunstnik. 1973. aastal lõpetas ta doktoriõppe ja hakkas 1984. aastal õpetama Ljubljana kunsti- ja disainiakadeemias bakalaureuse- ja magistritudengitele joonistust ja maali, mida jätkas kuni 1999. aastani. Aastatel 1977–1981 valiti ta kaks korda akadeemia dekaaniks. 1995. aastal valiti ta Ljubljanas Sloveenia Teaduste ja Kunstide Akadeemia assotsieerunud liikmeks ja 2001. aastal täisliikmeks.
Nagu paljud tema põlvkonna kunstnikud, liikus Jemec järk-järgult vabaduse poole, järgides värvide pakutavaid võimalusi. Väljendumine ja lugude jutustamine jooni kasutades muutus järk-järgult leebemaks, sedamööda kuidas kogus jõudu kujutamine värvide abil, mis sai lõpuks sõna otseses mõttes keskseks. Ta hakkas tasapisi seadma oma maalide keskmesse värvilaike, andes edasi värvi ja valguse struktuurset ja semantilist jõudu.
Jemec on osalenud arvukatel näitustel, sealhulgas Veneetsia biennaalil (kaks korda, 1970. ja 1972. aastal), Sao Paulo biennaalil (kaks korda, 1971. ja 1977. aastal) ja Ljubljana graafika biennaalil aastatel 1963–1999.
Ta on saanud oma töö eest arvukalt auhindu, sealhulgas: noorte Jugoslaavia kunstnike biennaali auhind Rijekas (Horvaatia) (1960); Grand Prix International neljandal rahvusvahelisel graafikabienaalil Tokyos (1964); aumedal Saksamaal Frechenis toimunud kolmandal rahvusvahelisel graafilise kunsti näitusel (1974); Jakopiči auhind, Ljubljana (1975), esimene auhind 11. rahvusvahelisel graafikabiennaalil, Ljubljana (1975); Silver Award rahvusvahelisel graafikatriennaalil Osakas, Jaapan (1991); Prešereni elutöö auhind, Ljubljana (1994); Golden Plaque Ljubljana ülikoolist (1998). 2005. aastal pälvis ta Austria teaduse ja kunsti auristi ning 2010. aastal Austria teaduse ja kunsti 1. klassi auristi.
Andrej Jemec elab ja töötab Ljubljanas.