Allen Jones syntyi Southamptonissa vuonna 1937. Kolme vuotta myöhemmin hänen perheensä muutti Lontoon länsipuolelle Ealingiin. Hän oli kiinnostunut taiteesta jo nuorena ja aloitti aktiivisesti maalauksen ja kivipainannan opiskelun vuonna 1955 Hornsey College of Art opistossa Lontoossa, josta hän valmistui neljä vuotta myöhemmin. Opiskeluaikanaan uteliaisuus johti hänen Provenceen Ranskaan, jossa hän tutustui Robert Delaunayn töihin. Jackson Pollockilla, jonka maalauksia hän näki Whitechapel Galleryssa vuonna 1958, oli tuolloin myös valtava vaikutus häneen.
Vuonna 1959 Jones lähti Hornsey Collegesta ja siirtyi Royal College of Art -kouluun. Tämä oli hänelle varmasti katkeransuloinen kokemus. Hän oli säännöllisesti yhteydessä muihin tulevaisuuteen suuntautuneisiin taiteilijoihin, joiden kanssa hän muodosti brittiläisen pop-taiteen ensimmäisen sukupolven, kuten R. B. Kitaj, Peter Phillips, David Hockney ja Derek Boshier. Näissä piireissä oli tuolloin käsinkosketeltava halu uudistaa: ”Halusin potkaista pois kaiken sen, mitä pidettiin hyväksyttävänä taiteena. Halusin löytää uuden esittämisen kielen… päästä irti ideasta, jonka mukaan figuratiivinen taide oli romanttista, ei vaativaa”. Valitettavasti hänen uusi instituutionsa ei hyväksynyt näitä taiteellisia muutoksia ja Jones erotettiin lukuvuoden 1960 lopussa esimerkkinä muille. Hän palasi Hornseyhin, josta hän valmistui vuonna 1961. Unohtaen turhautuneisuutensa Jones osallistui Royal Society of British Artistsin vuotuiseen Young Contemporaries -näyttelyyn vuonna 1961. Näyttelyssä olivat mukana myös David Hockney, R. B. Kitaj, Billy Apple, Derek Boshier, Joe Tilson, Patrick Caulfield ja Peter Blake, ja sitä pidetään näyttelynä, josta brittiläinen pop-taide sai alkunsa.
Jones oli kiinnostunut tavasta, jolla hänen edustamaansa tyyliä toteutettiin Yhdysvalloissa, ja hän siirtyi New Yorkiin vuonna 1964. Jones oppi Amerikassa, yhdessä hänen kanssaan Harkness-apurahalla työskennelleen ystävänsä ja taiteilijan Peter Phillipsin kanssa, että taiteen aikomus on esitettävä mahdollisimman selkeästi ja hän pyrki edistymään luomalla konkreettisia kuvia.
Ehkä juuri tästä syystä hän ryhtyi Lontooseen palattuaan myös kuvanveistäjäksi, mistä hänet nykyisin tunnetaan ehkä kaikkein parhaiten. Vuosi 1969 oli käännekohta. Silloin hän loi lasikuitutyön nimeltä Chair, joka herätti silloin – ja herättää edelleen – paljon polemiikkia. Työ on saanut inspiraationsa BDSM:stä, ja siksi se on eksplisiittisen seksuaalinen ja eroottinen työ ja näyttää esineistävän naisen asettamalla tämän samalle tasolle huonekalun kanssa. Työssä havaittu misogynia teki Jonesista kiistojen ja keskustelujen kohteen taidemaailmassa useiden vuosikymmenien ajaksi. Aina kun hänen työnsä on näytteillä, se aiheuttaa kiistoja ja syytteitä naisvihasta. Jones ei pystynyt osallistumaan moniin tapahtumiin toistuvien välikohtausten johdosta.
1970-luvulla hän ryhtyi taas maalaamaan kankaalle käyttäen yksinkertaistettuja muotoja ja korostaen selvästi väriä, jota hän käytti ”liikkeen käsitteen luomiseen kuvassa, jossa vuorottelevat keltaiset ja vihreät haarat vinosti vastakkaisissa asennoissa”. Liverpoolin Walker Art Galleryssa pidettiin suuri retrospektiivinen näyttely hänen työstään vuonna 1979, ja myöhemmin näyttely siirtyi Lontoon Serpentine Galleryyn. 2000-luvun myöhemmissä töissä hän palasi uudelleen kuvanveistoon luomalla monumentaalisia teräskappaleita, jotka perustuvat toisiinsa kietoutuneisiin nimettömiin hahmoihin. Hänen kehityttyään taiteilijana ja ihmisenä, hänet hyväksyttiin takaisiin taidemaailmaan. Hänen töitään oli esillä Pop Art Portraits -näyttelyssä National Portrait Galleryssa Lontoossa, ja hänen vesiväritöilleen, piirustuksilleen ja maalauksilleen on omistettu oma sali Tate Britain -galleriassa. Vuonna 2008 hänen vesiväritöilleen omistettiin oma sali Royal Academy of Artsissa.
Allen Jones asuu ja työskentelee Lontoossa.
