Markus Lüpertz syntyi Reichenbergissä (nykyisin Liberec,Tšekki) vuonna 1941. Hän opiskeli Krefeldin taideakatemiassa Laurens Goosensin ohjauksessa ja vietti myös yhden lukukauden Kunstakademiessa Düsseldorfissa (Düsseldorfin taideakatemia).
Vuonna 1962 hän asettui Länsi-Berliiniin, jossa hän perusti Großgörschen 35 -gallerian yhdessä Bernd Koberlingin ja Karl Horst Hödicken kanssa. Siellä hän kehittyi taiteilijana, alkoi saavuttaa mainetta ja loi verkoston, johon kuuluivat esimerkiksi Jörg Immendorff ja Georg Baselitz sekä entinen liittokansleri Gerhard Schröder. Vuosien vieriessä Lüpertz tuli tunnetuksi nimellä ”taidemaalarien prinssi” hänen erittäin teatraalisen ja näyttävän julkisen esiintymisensä, itsekeskeisen retoriikkansa ja ylellisen elämäntyylinsä vuoksi.
Taiteessaan Lüpertz ryhtyi tarkoituksella vastustamaan ajan päätrendejä pysytellen etäällä minimalismin ja konseptualismin kylmästä faktuaalisuudesta ja omaksui täysin uusekspressionismin. Tämä merkitsi figuratiivisuuden sekä yksinkertaisten ja keskeisten aiheiden omaksumista ja ilmeikästä hyödyntämistä. Hänen varhaista Berliinin-teossarjaansa nimeltä ”dityrambisia maalauksia”, joka oli esillä hänen omassa galleriassaan vuonna 1964, pidetään usein alkusysäyksenä sille esteettiselle suuntaukselle, joka myöhemmin kehittyi huippuunsa ja jonka johtohahmo hänestä tuli.
Vuosina 1969–1977 hän tutki suurempia muotoja sarjassa, joka sisälsi Saksan historiasta peräisin olevia symboleja, aiheita ja otteita, joista kypärät, liput ja sotamuistomerkit olivat merkittävässä asemassa. Tuolloin (1976) hänet nimitettiin professoriksi Staatliche Akademie der Bildenden Künstessa (Karlsruhen valtion taideakatemia), Karlsruhessa.
Historiapainotteisen työnsä jälkeen Lüpertz kehitti tunnetuimman tyylinsä, jossa hän palasi 30 vuotta aiemmin vallinneen abstraktion pariin. Lüpertzin kyky katsoa taaksepäin vei hänet myöhemmin halki ajan, tilan ja (taiteen) historian, kun hän omaksui vaikutteita esimerkiksi Poussinilta ja Corot’lta.
Vuonna 1977 pidettiin hänen ensimmäinen retrospektiivinsä Kunsthallessa, Hampurissa. Sen saama myönteinen vastaanotto ja huomio valmistivat tietä näyttelyille arvostetuissa instituutioissa, kuten Bernissä, Stedelijk Museumissa Amsterdamissa ja Van Abbemuseumissa Eindhovenissa.
Vuonna 1986 hänet nimitettiin professoriksi Kunstakademie Düsseldorfissa (Düsseldorfin taideakatemia), ja muutaman vuoden kuluttua hänestä tuli oppilaitoksen johtaja.
Tärkeitä retrospektiivejä ovat esimerkiksi seuraavat: Kunsthalle, Hampuri, Saksa (1977); Museo Nacional Centro de Arte Reina Sofia, Madrid, Espanja (1991) ja Musée d’art moderne de la ville de Paris, Ranska (2015).
Lüpertzille on myönnetty seuraavat palkinnot: Villa Romana -palkinto (1970); Saksan arvostelijoiden yhdistyksen palkinto (1971); Lovis Corinth -palkinto (1990); ja neljäs Julio González -palkinto (2004). Lüpertz kutsuttiin Breslaun taideakatemian kunniatohtoriksi vuonna 2006.
Lüpertz asuu ja työskentelee Berliinissä, Karlsruhessa, Düsseldorfissa ja Firenzessä, maalaa, kirjoittaa runoja ja soittaa silloin tällöin jazz-pianoa.
